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seuratclustering - 使用 Seurat 对单细胞 RNA-seq 数据聚类

使用 Seurat 通过近邻图、UMAP 以及 Louvain 或 Leiden 算法对单细胞 RNA-seq 数据进行无监督聚类。

标签

更新于: 2026-10-01
单细胞 RNA-seqSeurat无监督聚类UMAPLeidenLouvain

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 查找近邻
  • 计算 UMAP 嵌入
  • 识别细胞簇
  • 探索聚类分辨率

输入

  • Seurat 对象
  • 聚类配置

输出

  • 近邻图
  • UMAP 嵌入
  • 细胞簇标签
  • 更新后的 Seurat 对象
  • 缓存的中间结果

要求

  • 兼容 Seurat 的运行环境
  • 已准备的单细胞 RNA-seq 数据

来源

  • 规范: SKILL.md
查找近邻
计算 UMAP 嵌入
识别细胞簇
探索聚类分辨率
Seurat 对象
聚类配置
近邻图
UMAP 嵌入
细胞簇标签