tooluniverse-protein-interactions - 蛋白质相互作用网络分析
基于STRING、BioGRID和SASBDB数据库，通过标识符映射、网络检索、富集分析和结构数据查询四个阶段分析蛋白质-蛋白质相互作用网络。
标签
更新于: 2026-06-30能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 映射蛋白质标识符
- 检索相互作用网络
- 执行功能富集分析
- 搜索SAXS/SANS结构数据
- 查询BioGRID审校相互作用
- 获取信号通路相互作用
- 映射蛋白质到Reactome通路
- 查询药物-基因相互作用
- 获取基因成药性分类
- 获取基因约束指标
- 搜索临床证据条目
- 获取蛋白质功能注释
- 计算多聚体结合价数
- 预测卷曲螺旋寡聚态
输入
- 蛋白质名称或UniProt ID
- NCBI分类学ID
- 置信度分数阈值
- BioGRID API密钥（可选）
- 基因符号
输出
- 含置信度评分的相互作用网络数据
- 功能富集分析结果
- SAXS/SANS结构数据条目
- 药物-基因相互作用报告
- 基因约束与必需性指标
要求
- STRING API访问（无需密钥）
- BioGRID API密钥用于备选相互作用数据
- SASBDB API访问用于结构数据
- ToolUniverse运行环境