anndata - 基因组学注释数据结构
单细胞基因组学注释数据矩阵的 Python 包
标签
更新于: 2026-06-30能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 创建 AnnData 对象
- 读取 h5ad 文件
- 写入 h5ad 文件
- 读取 CSV 文件
- 读取 loom 文件
- 读取 10X h5 文件
- 写入 zarr 文件
- 写入 CSV 文件
- 子集数据
- 过滤数据
- 连接对象
- 转置数据
- 复制对象
- 转换稀疏矩阵
- 访问元数据
- 支持模式读取
- 压缩数据
输入
- h5ad 文件
- CSV 文件
- loom 文件
- 10X h5 文件
- zarr 目录
- numpy 数组
- pandas DataFrame
输出
- h5ad 文件
- zarr 目录
- CSV 目录
- AnnData 对象
- 数据子集
- 压缩文件
要求
- Python 环境
- uv pip
- scipy 稀疏矩阵支持
- scanpy 分析工作流
- scvi-tools 概率模型
- cellxgene-census 大规模查询