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  • scanpy - 使用 Scanpy 分析单细胞 RNA 测序数据
    单细胞 RNA 测序生物信息学ScanpyAnnData

    ★ 2 · 更新于 2026-09-29

    执行单细胞 RNA 测序的质控、标准化、降维、聚类、差异表达、可视化及 R 格式到 h5ad 的转换。

    ⚙ 执行质量控制⚙ 标准化表达数据⚙ 计算 PCA 嵌入
  • anndata - 基因组学注释数据结构
    单细胞基因组学数据结构h5adzarr

    ★ 0 · 更新于 2026-06-30

    单细胞基因组学注释数据矩阵的 Python 包

    ⚙ 创建 AnnData 对象⚙ 读取 h5ad 文件⚙ 写入 h5ad 文件
  • scvitools-docs-truly-complete - scvi-tools 完整文档指南
    单细胞分析深度学习模型训练生物信息学

    ★ 650 · 更新于 2026-06-30

    scvi-tools 深度学习单细胞分析工具包完整文档助手

    ⚙ 加载单细胞数据⚙ 训练 SCVI 模型⚙ 设置 AnnData
  • anndata - 单细胞注释数据矩阵结构
    数据结构单细胞基因组学生物信息学

    ★ 97 · 更新于 2026-06-30

    用于处理注释数据矩阵的 Python 包，支持高效存储和操作

    ⚙ 创建 AnnData 对象⚙ 读取 h5ad 文件⚙ 写入 h5ad 文件