anndata - 单细胞分析注释数据矩阵格式
用于单细胞基因组学中处理注释数据矩阵的Python包，支持h5ad、zarr等格式
标签
更新于: 2026-06-30能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 创建AnnData对象
- 读取h5ad文件
- 写入h5ad文件
- 读取CSV文件
- 读取Loom文件
- 读取10X H5文件
- 写入Zarr文件
- 写入CSV文件
- 子集筛选
- 数据过滤
- 连接数据集
- 数据转换
- 添加元数据
- 数据转置
- 数据复制
- 重命名观测
- 重命名变量
- 字符串转分类
- 访问数据组件
输入
- h5ad文件
- CSV文件
- Loom文件
- 10X H5文件
- MTX文件
- Excel文件
- Zarr目录
- 观测元数据
- 变量元数据
- 数据矩阵
输出
- AnnData对象
- h5ad文件
- Zarr文件
- CSV文件
- 过滤数据子集
- 连接数据集
- 转换后数据
要求
- Python环境
- numpy
- pandas