bio-longread-qc - 长读长测序质量控制
生成长读长测序数据的QC报告，按长度和质量过滤reads，并可视化reads特征
标签
更新于: 2026-03-21能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 生成QC报告
- 按长度过滤reads
- 按质量过滤reads
- 可视化reads分布
- 计算reads统计
- 修剪reads接头
- 解析FASTQ质量
- 生成图表
- 计算N50
输入
- FASTQ文件
- BAM文件
- 测序摘要文件
- 质量阈值
- 长度阈值
输出
- QC报告
- 过滤后的reads
- 质量图表
- 统计文件
- N50值
- 修剪后的reads
要求
- BioPython 1.83+
- numpy 1.26+
- NanoPlot
- NanoStat
- chopper
- Python环境