使用输入“FASTQ文件”的 Skills

bioinformatics-engineer - 构建并运行生产级基因组学流程
生物信息学基因组学工作流编排 Nextflow
★ 1 · 更新于 2026-10-07
使用工作流引擎、固定容器、质量控制门禁、持续集成和溯源机制构建、测试并运行可复现的基因组学流程。
⚙ 设计基因组学DAG ⚙ 构建工作流流程 ⚙ 固定参考和容器版本
pysam - 基因组数据处理工具包
生物信息学基因组学 NGS 测序
★ 399 · 更新于 2026-06-15
读写 SAM/BAM/CRAM 比对、VCF/BCF 变异、FASTA/FASTQ 序列，用于 NGS 数据处理流程
⚙ 读取比对文件 ⚙ 写入比对文件 ⚙ 获取基因组区域
pysam - 基因组文件处理工具
生物信息学基因组学测序 NGS
★ 55 · 更新于 2026-06-15
读写基因组文件、查询区域、计算覆盖度，用于NGS数据处理
⚙ 读取对齐文件 ⚙ 写入对齐文件 ⚙ 读取变异文件
pysam - 基因组文件处理工具包
基因组学生物信息学测序比对
★ 3,038 · 更新于 2026-06-15
读写基因组比对、变异和序列文件用于测序数据处理
⚙ 读取SAM/BAM/CRAM文件 ⚙ 读取VCF/BCF文件 ⚙ 读取FASTA/FASTQ文件
bio-splicing-pipeline - RNA-seq可变剪接分析流程
可变剪接 RNA测序差异分析生物信息学
★ 1,214 · 更新于 2026-03-25
从FASTQ到差异剪接结果的端到端可变剪接分析流程
⚙ 修剪FASTQ序列 ⚙ 比对RNA-seq数据 ⚙ 检测剪接位点饱和度
bio-longread-qc - 长读长测序数据质量控制
生物信息学长读长测序质量控制 ONT
★ 0 · 更新于 2026-03-21
使用NanoPlot、NanoStat和chopper对长读长测序数据进行质量控制
⚙ 读取FASTQ文件 ⚙ 读取BAM文件 ⚙ 读取测序摘要文件
bio-longread-qc - 长读长测序质量控制
长读长测序质量控制 Nanopore PacBio
★ 0 · 更新于 2026-03-21
生成长读长测序数据的QC报告，按长度和质量过滤reads，并可视化reads特征
⚙ 生成QC报告 ⚙ 按长度过滤reads ⚙ 按质量过滤reads
bio-read-qc-quality-reports - 使用FastQC和MultiQC生成并解读FASTQ质量报告
生物信息学质量控制测序 FASTQ
★ 33 · 更新于 2026-02-11
为FASTQ文件生成质量报告并汇总多个报告
⚙ 对FASTQ文件运行FastQC ⚙ 用MultiQC汇总报告 ⚙ 处理多个样本
bio-read-qc-quality-reports - 使用FastQC和MultiQC分析FASTQ文件质量
生物信息学质量控制测序 fastq
★ 650 · 更新于 2026-02-11
使用FastQC和MultiQC从FASTQ文件生成并解读质量报告
⚙ 运行FastQC分析 ⚙ 生成MultiQC报告 ⚙ 提取质量指标
sc-best-practices-auto - 单细胞分析最佳实践自动发现工具
单细胞生物信息学文档自动化
★ 22 · 更新于 2026-02-11
自动发现并抓取单细胞分析最佳实践的文档、HTML/MD文件和代码块
⚙ 发现文档索引 ⚙ 抓取HTML内容 ⚙ 提取MD文件