bio-methylation-dmr-detection - 甲基化差异区域检测
使用methylKit、bsseq和DMRcate方法检测差异甲基化区域
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更新于: 2026-03-10能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 读取甲基化数据
- 过滤覆盖度数据
- 创建基因组窗口
- 计算差异甲基化
- 检测差异甲基化区域
- 用基因注释DMR
- 可视化DMR轨迹
- 合并相邻DMR
- 导出DMR文件
输入
- 覆盖度文件
- 样本元数据
- 基因组组装
- 处理条件
- 基因注释
输出
- DMR列表
- 注释的DMR
- DMR可视化轨迹
- BED文件
- CSV文件
- GFF3文件
要求
- R环境
- methylKit包
- bsseq包
- DMRcate包
- 多核支持