molecular-dynamics-guide - 设置和分析分子动力学模拟分子动力学模拟计算化学生物物理★ 158 · 更新于 2026-03-25使用 GROMACS 和 OpenMM 设置、运行和分析分子动力学模拟⚙ 准备模拟系统⚙ 处理 PDB 结构⚙ 生成拓扑文件