cnn-inference-on-spectral-data - 使用 CNN 从二级质谱数据生成分子嵌入向量
将预处理的二级质谱数据输入已训练的 CNN 模型,提取用于下游代谢物匹配的多维分子嵌入向量。
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更新于: 2026-09-19能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 加载预处理的 MS/MS 质谱数据
- 初始化已训练的 CNN 模型
- 提取分子嵌入向量
- 保存嵌入特征矩阵至磁盘
输入
- 预处理的 MS/MS 质谱数据
- 已训练的 CNN 模型权重文件
- MSP 格式质谱文件
- YAML 配置文件
输出
- 多维分子嵌入向量
- CSV 或 NumPy 格式的嵌入特征矩阵
要求
- PyTorch 框架
- ChemEmbed cnn_train 模块
- 预训练的 CNN 模型权重
