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案例技能关于
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ena-database - 检索并获取欧洲核苷酸档案库的基因组数据

通过 REST API 以及 FTP 或 Aspera 访问欧洲核苷酸档案库,检索并获取序列、原始测序数据、组装结果和元数据。

标签

更新于: 2026-09-19
基因组学生物信息学ENAREST API序列检索

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 下载原始测序数据
  • 按元数据筛选搜索记录
  • 获取记录元数据
  • 查询分类学谱系与阶元
  • 通过校验和获取参考序列

输入

  • 接纳号
  • 元数据查询条件
  • 分类 ID
  • 参考序列校验和

输出

  • FASTQ 文件
  • FASTA 文件
  • BAM 或 CRAM 文件
  • XML、JSON 或 TSV 元数据
  • EMBL 扁平文件

要求

  • Python >= 3.9
  • requests >= 2.31.0
  • lxml >= 4.9.0

来源

  • 规范: SKILL.md

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