ena-database - 检索并获取欧洲核苷酸档案库的基因组数据
通过 REST API 以及 FTP 或 Aspera 访问欧洲核苷酸档案库,检索并获取序列、原始测序数据、组装结果和元数据。
标签
更新于: 2026-09-19能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 下载原始测序数据
- 按元数据筛选搜索记录
- 获取记录元数据
- 查询分类学谱系与阶元
- 通过校验和获取参考序列
输入
- 接纳号
- 元数据查询条件
- 分类 ID
- 参考序列校验和
输出
- FASTQ 文件
- FASTA 文件
- BAM 或 CRAM 文件
- XML、JSON 或 TSV 元数据
- EMBL 扁平文件
要求
- Python >= 3.9
- requests >= 2.31.0
- lxml >= 4.9.0
