ena-database - 访问 ENA 核酸序列及基因组学元数据。
通过 REST API 和 FTP 从欧洲核苷酸档案馆检索 DNA/RNA 序列、原始 FASTQ 读取、基因组组装及元数据。
标签
更新于: 2026-09-18能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 检索核酸序列与测序数据
- 搜索样本、研究与组装数据
- 下载 FASTQ 文件与基因组组装
- 查询生物分类学记录
- 访问交叉引用服务记录
- 按校验和检索参考序列
输入
- 数据登录号
- 分类学 ID 或物种名称
- 元数据查询参数
- MD5 或 SHA1 校验和
输出
- FASTQ 测序数据文件
- FASTA 及 EMBL 序列文件
- BAM 及 CRAM 比对文件
- JSON、XML 或 TSV 元数据记录
要求
- 访问 ENA API 端点与 FTP 服务器的网络连接
- 遵守每秒 50 次请求的 API 速率限制
- 用于大批量下载的 enaBrowserTools 或 Aspera 客户端