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ensembl-database - 查询 Ensembl REST API 以获取基因组数据和变异信息

查询 Ensembl 基因组数据库 REST API,获取基因注释、序列、变异分析预测、同源基因及基因组组装坐标转换。

标签

更新于: 2026-09-19

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 获取基因注释与信息
  • 检索 DNA 及蛋白质序列
  • 预测分析基因变异影响
  • 查找直系及旁系同源基因
  • 分析基因组区域特征
  • 转换基因组组装坐标

输入

  • 基因符号或 Ensembl ID
  • 基因组坐标或区域
  • rsID 或 HGVS 标记

输出

  • 基因元数据与注释
  • JSON 或 FASTA 格式序列
  • 变异效应预测结果
  • 同源基因数据
  • 转换后的组装坐标

要求

  • Python 运行环境
  • ensembl_rest 包或 requests 库
  • 至 Ensembl REST API 的网络连接

来源

  • 规范: SKILL.md

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