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ensembl-database - 查询 Ensembl 基因组数据库 REST API

通过 Ensembl REST API 查询 250+ 物种的基因注释、序列、变异、同源基因、VEP 预测及组装比对。

标签

更新于: 2026-09-19
ensembl基因组学生物信息学rest-api遗传变异

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 检索基因信息
  • 获取基因组序列
  • 分析遗传变异
  • 查找同源基因
  • 分析基因组区域
  • 转换组装坐标

输入

  • 基因符号或 Ensembl ID
  • 基因组区域坐标
  • 变异 HGVS 表示或 rsID
  • 物种名称
  • 基因组组装版本名称

输出

  • 基因注释
  • DNA 转录本及蛋白质序列
  • 变异影响预测结果
  • 同源基因数据
  • 基因组区域特征
  • 映射后的组装坐标

要求

  • 访问 Ensembl REST API 的网络连接
  • ensembl_rest Python 包或 requests 库

来源

  • 规范: SKILL.md
检索基因信息
获取基因组序列
分析遗传变异
查找同源基因
基因符号或 Ensembl ID
基因组区域坐标
变异 HGVS 表示或 rsID
基因注释
DNA 转录本及蛋白质序列
变异影响预测结果