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matchms - 质谱数据处理与分析库

处理和分析质谱数据,计算谱图相似度,并统一元数据。

标签

更新于: 2026-02-11
质谱分析代谢组学数据处理谱图分析生物信息学

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 从文件导入谱图
  • 导出处理后的谱图
  • 对谱图应用过滤器
  • 计算谱图相似度
  • 构建处理流程
  • 标准化元数据
  • 可视化谱图

输入

  • mzML 文件
  • MGF 文件
  • MSP 文件
  • JSON 谱图数据
  • 元数据文件
  • 谱图库

输出

  • 处理后的谱图文件
  • 相似度得分矩阵
  • 标准化元数据
  • 谱图可视化
  • 分析报告

要求

  • Python 3.7+
  • 已安装 matchms 库
  • 可选:用于化学功能的 RDKit

来源

  • 规范: SKILL.md
从文件导入谱图
导出处理后的谱图
对谱图应用过滤器
计算谱图相似度
mzML 文件
MGF 文件
MSP 文件
处理后的谱图文件
相似度得分矩阵
标准化元数据