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案例技能关于
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matchms - 质谱数据处理与分析库

处理质谱数据,支持光谱相似性计算和元数据标准化

标签

更新于: 2026-03-22
质谱光谱分析代谢组学光谱相似性数据处理化学生物信息学

能力

从文件导入光谱导出光谱到文件过滤光谱元数据归一化峰强度

典型输入

mzML文件mzXML文件MGF文件

典型输出

处理后的光谱文件相似度评分过滤后的光谱

该技能可以做什么

  • 从文件导入光谱
  • 导出光谱到文件
  • 过滤光谱元数据
  • 归一化峰强度
  • 按强度选择峰
  • 计算余弦相似度
  • 计算修正余弦相似度
  • 构建处理流水线
  • 标准化元数据键
  • 从SMILES推导InChI
  • 添加分子指纹
  • 绘制光谱图
  • 比较两个光谱

输入

  • mzML文件
  • mzXML文件
  • MGF文件
  • MSP文件
  • JSON文件
  • 光谱库
  • 查询光谱
  • 参考光谱
  • SMILES字符串
  • Pickle文件

输出

  • 处理后的光谱文件
  • 相似度评分
  • 过滤后的光谱
  • 光谱图
  • 标准化元数据
  • InChI字符串
  • InChIKey字符串
  • 分子指纹

要求

  • Python环境
  • matchms库
  • 可选化学依赖包

来源

  • 规范: SKILL.md

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