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metabolic-module-significance-calculation - 计算代谢模块对样本特征的显著性统计量

计算模块显著性统计量,评估代谢相关性模块与类别样本特征的统计显著关联。

标签

更新于: 2026-09-19

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 计算模块显著性统计量
  • 绘制模块特征关联图
  • 提取显著代谢相关模块
  • 计算模块特征代谢物值

输入

  • 包含归一化代谢物测量数据的 MultiAssayExperiment 对象
  • 包含 WGCNA 模块分配的代谢物 rowData
  • 包含类别特征注释的样本 colData

输出

  • 每个模块与特征的模块显著性统计量
  • 模块-特征关联的 p 值与效应估计值
  • 模块-特征关联的 MS_plot 可视化图
  • 每个模块的代谢物显著性值
  • 模块特征代谢物值

要求

  • R 语言版本 4.0.2 或更高版本
  • MetaboDiff R 软件包
  • WGCNA R 软件包
  • MultiAssayExperiment R 软件包

来源

  • 规范: SKILL.md
代谢组学
WGCNA
MetaboDiff
模块显著性
R软件包
生物信息学
计算模块显著性统计量
绘制模块特征关联图
提取显著代谢相关模块
计算模块特征代谢物值
包含归一化代谢物测量数据的 MultiAssayExperiment 对象
包含 WGCNA 模块分配的代谢物 rowData
包含类别特征注释的样本 colData
每个模块与特征的模块显著性统计量
模块-特征关联的 p 值与效应估计值
模块-特征关联的 MS_plot 可视化图