metabolic-module-significance-calculation - 计算代谢模块对样本特征的显著性统计量
计算模块显著性统计量,评估代谢相关性模块与类别样本特征的统计显著关联。
标签
更新于: 2026-09-19能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 计算模块显著性统计量
- 绘制模块特征关联图
- 提取显著代谢相关模块
- 计算模块特征代谢物值
输入
- 包含归一化代谢物测量数据的 MultiAssayExperiment 对象
- 包含 WGCNA 模块分配的代谢物 rowData
- 包含类别特征注释的样本 colData
输出
- 每个模块与特征的模块显著性统计量
- 模块-特征关联的 p 值与效应估计值
- 模块-特征关联的 MS_plot 可视化图
- 每个模块的代谢物显著性值
- 模块特征代谢物值
要求
- R 语言版本 4.0.2 或更高版本
- MetaboDiff R 软件包
- WGCNA R 软件包
- MultiAssayExperiment R 软件包
