polars-bio - 基因组区间运算与生物信息文件读写
执行基因组区间运算，读写生物信息学文件格式，流式处理大型数据集，并使用 SQL 查询基因组数据。
标签
更新于: 2026-09-28能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 查找重叠区间
- 统计区间重叠
- 查找最近区间
- 合并基因组区间
- 聚类基因组区间
- 计算区间覆盖度
- 查找区间补集
- 减去重叠区间
- 读取生物信息学文件
- 写入生物信息学文件
- 惰性扫描大型文件
- 使用 SQL 查询基因组数据
- 计算读取深度
- 注册数据表
输入
- Polars DataFrame
- 基因组区间列
- 生物信息学文件
- SQL 查询
- 云存储路径
输出
- LazyFrame 或 DataFrame
- SQL 查询结果
- 写入的生物信息学文件
- 已注册的 SQL 表
要求
- Python 环境
- polars-bio 软件包