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reactome-database - 通过REST API查询Reactome通路数据库

查询Reactome REST API以进行通路分析、富集分析、基因-通路映射和分子相互作用

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更新于: 2026-03-25

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 查询通路数据
  • 查询特定实体
  • 检索通路信息
  • 获取数据库版本
  • 获取参与分子
  • 执行富集分析
  • 分析表达数据
  • 映射基因到通路
  • 跨物种比较通路
  • 检索分析结果

输入

  • 基因或蛋白质标识符
  • 基因表达数据
  • 通路标识符
  • 标识符文本列表
  • TSV格式表达文件

输出

  • 通路信息
  • 富集通路
  • 分子实体
  • 分析摘要
  • 可视化链接

要求

  • 网络访问
  • Python客户端
  • reactome2py

来源

  • 规范: SKILL.md

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