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reactome-database - Reactome通路数据库与分析

通过Reactome REST API和Python客户端查询通路分析、富集和基因通路映射

标签

更新于: 2026-03-25
通路分析系统生物学基因组学生物信息学REST API

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 查询通路信息
  • 查询特定实体
  • 获取参与分子
  • 检索数据库版本
  • 执行富集分析
  • 分析表达数据
  • 映射标识符到通路
  • 跨物种比较通路
  • 获取分析结果

输入

  • 基因标识符
  • 蛋白标识符
  • 表达数据文件
  • 通路标识符
  • 实体标识符

输出

  • 通路信息
  • 富集分析结果
  • 分子相互作用数据
  • 分析令牌
  • 可视化链接

要求

  • 网络连接
  • Python环境
  • HTTP访问

来源

  • 规范: SKILL.md
查询通路信息
查询特定实体
获取参与分子
检索数据库版本
基因标识符
蛋白标识符
表达数据文件
通路信息
富集分析结果
分子相互作用数据