anndata - Python带注释数据矩阵管理
在Python中处理带元数据注释的数据矩阵
标签
更新于: 2026-06-30能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 创建AnnData对象
- 读取h5ad文件
- 写入h5ad文件
- 读取CSV文件
- 读取Loom文件
- 写入zarr文件
- 连接数据集
- 选择观测值
- 选择变量
- 过滤数据
- 转置数据
- 复制数据
- 管理元数据
- 转换格式
- 使用backed模式
输入
- h5ad文件
- zarr文件
- CSV文件
- MTX文件
- Loom文件
- 10X文件
- numpy数组
- pandas数据框
输出
- h5ad文件
- zarr文件
- CSV文件
- 过滤后的数据集
- 子集数据集
- 连接后的数据集
要求
- Python环境
- anndata包