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带有该标签的 Skills：单细胞

浏览带有该标签的技能列表。

  • single-cell-multi-omics-integration - 单细胞多组学整合
    单细胞多组学数据整合OmicVerse

    ★ 602 · 更新于 2026-09-16

    涵盖 MOFA、GLUE 配对、SIMBA 整合、TOSICA 迁移及 StaVIA 轨迹映射的 OmicVerse 教程速查表。

    ⚙ 整合配对的转录组与染色质可及性⚙ 结合 GLUE 与 MOFA 整合未配对数据⚙ 运行 SIMBA 批次效应整合
  • scvelo - 单细胞RNA速度分析工具
    单细胞RNA测序轨迹推断生物信息学

    ★ 5 · 更新于 2026-06-30

    从未剪接/已剪接mRNA动力学估计单细胞RNA测序数据中的细胞状态转换

    ⚙ 加载数据⚙ 过滤和归一化⚙ 计算矩
  • anndata - Python带注释数据矩阵管理
    生物信息学单细胞基因组学数据结构

    ★ 422 · 更新于 2026-06-30

    在Python中处理带元数据注释的数据矩阵

    ⚙ 创建AnnData对象⚙ 读取h5ad文件⚙ 写入h5ad文件
  • anndata - 单细胞注释数据矩阵结构
    数据结构单细胞基因组学生物信息学

    ★ 97 · 更新于 2026-06-30

    用于处理注释数据矩阵的 Python 包，支持高效存储和操作

    ⚙ 创建 AnnData 对象⚙ 读取 h5ad 文件⚙ 写入 h5ad 文件
  • dynamo-pseudotime-velocity - 伪时间转RNA速度
    RNA速度伪时间向量场命运预测

    ★ 502 · 更新于 2026-06-15

    将伪时间转换为可重用的RNA速度输出，支持向量场重建

    ⚙ 预处理数据⚙ 降维⚙ 计算邻域
  • bio-single-cell-clustering - 单细胞RNA测序聚类分析
    单细胞聚类生物信息学降维

    ★ 18 · 更新于 2026-03-20

    使用Seurat或Scanpy对单细胞RNA测序数据进行降维和聚类

    ⚙ 运行PCA⚙ 计算近邻图⚙ 运行Leiden聚类
  • bio-single-cell-clustering - 单细胞RNA测序聚类分析
    单细胞RNA测序聚类降维

    ★ 602 · 更新于 2026-03-20

    使用Seurat和Scanpy进行单细胞RNA测序降维和聚类

    ⚙ 运行PCA分析⚙ 计算方差比例⚙ 可视化PCA
  • universal-single-cell-annotator - 通用单细胞RNA-seq数据注释器
    基因组学生物信息学单细胞注释

    ★ 18 · 更新于 2026-02-12

    使用标记基因、深度学习或LLM推理注释单细胞RNA-seq数据

    ⚙ 用标记基因评分细胞⚙ 从celltypist迁移标签⚙ 提取标记用于LLM解释
  • sc-best-practices-auto - 单细胞分析最佳实践集合与自动发现
    单细胞最佳实践文档自动化

    ★ 3 · 更新于 2026-02-11

    自动发现并收集单细胞分析最佳实践文档、HTML/MD文件和代码块

    ⚙ 发现目录索引⚙ 抓取HTML文件⚙ 收集MD文档
  • sc-best-practices-auto - 单细胞分析最佳实践自动发现工具
    单细胞生物信息学文档自动化

    ★ 18 · 更新于 2026-02-11

    自动发现并抓取单细胞分析最佳实践的文档、HTML/MD文件和代码块

    ⚙ 发现文档索引⚙ 抓取HTML内容⚙ 提取MD文件