bio-chip-seq-motif-analysis - ChIP-seq模体发现与富集分析
使用HOMER和MEME-ChIP识别ChIP-seq或ATAC-seq峰中富集的DNA序列模体
标签
更新于: 2026-05-11能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 识别富集模体
- 发现新模体
- 扫描基因组模体
- 比对模体数据库
- 创建自定义模体
- 提取峰序列
- 解析模体结果
- 可视化模体标识
输入
- ChIP-seq峰数据
- ATAC-seq峰数据
- 基因组序列
- 模体数据库
- 背景区域
- 基因组参考序列
输出
- 发现的模体
- 模体富集统计
- 模体注释文件
- 序列标识图
- 模体位置文件
要求
- 已安装HOMER
- 已安装MEME Suite
- 已安装bedtools
- conda环境
- 配置基因组
- CPU计算资源