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带有该标签的 Skills:基序分析

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  • archr - 使用 R 和 ArchR 分析 scATAC-seq 数据
    单细胞 ATAC-seqRArchR表观基因组学

    ★ 98 · 更新于 2026-10-01

    运行基于 R 的 scATAC-seq 流程,包括 Arrow 文件、降维、聚类、基因评分、峰调用、基序分析、chromVAR、足迹分析、整合和轨迹分析。

    ⚙ 创建 Arrow 文件⚙ 推断双细胞⚙ 运行迭代 LSI
  • bio-chip-seq-motif-analysis - ChIP-seq模体发现与富集分析
    生物信息学ChIP-seqATAC-seq模体分析

    ★ 22 · 更新于 2026-05-11

    使用HOMER和MEME-ChIP识别ChIP-seq或ATAC-seq峰中富集的DNA序列模体

    ⚙ 识别富集模体⚙ 发现新模体⚙ 扫描基因组模体
  • bio-chip-seq-motif-analysis - ChIP-seq/ATAC-seq 基序分析
    生物信息学ChIP-seqATAC-seq基序分析

    ★ 650 · 更新于 2026-05-11

    使用 HOMER 和 MEME 识别基因组峰数据中富集的 DNA 序列基序

    ⚙ 查找富集基序⚙ 与数据库比较基序⚙ 扫描基因组匹配