universal-single-cell-annotator - 通用单细胞RNA-seq数据注释器
使用标记基因、深度学习或LLM推理注释单细胞RNA-seq数据
标签
更新于: 2026-02-12能力
典型输入
典型输出
该技能可以做什么
- 用标记基因评分细胞
- 从celltypist迁移标签
- 提取标记用于LLM解释
输入
- 单细胞RNA-seq数据
- 基因标记列表
- AnnData对象
输出
- 注释的细胞类型预测
- 更新的adata.obs列
- 细胞类型标签
要求
- Python 3.9+
- scanpy库
- AnnData格式