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  • bio-read-alignment-bwa-alignment - 使用 BWA-MEM2 比对 DNA 短读段
    DNA 测序短读段比对BWA-MEM2参考基因组

    ★ 6 · 更新于 2026-10-04

    使用 BWA-MEM2 或 BWA-MEM 将双端或单端 DNA 短读段比对到参考基因组,并注入读组信息及准备 BAM 输出。

    ⚙ 比对双端读段⚙ 比对单端读段⚙ 构建参考索引
  • bio-duplicate-handling - 标记或移除 PCR 与光学重复
    生物信息学BAM重复标记samtools

    ★ 0 · 更新于 2026-10-01

    使用 samtools fixmate 和 markdup 处理 BAM 比对中的 PCR 与光学重复,并根据实验类型判断是否适合去重。

    ⚙ 标记 PCR 重复⚙ 移除重复读段⚙ 检测光学重复
  • bio-duplicate-handling - 标记或移除 PCR 与光学重复序列
    生物信息学BAM测序重复序列处理

    ★ 0 · 更新于 2026-09-29

    使用 samtools fixmate 和 markdup 在 BAM 文件中标记或移除 PCR 与光学重复序列,以支持下游分析。

    ⚙ 排序 BAM 比对结果⚙ 添加配对标签⚙ 标记重复读段