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scvitools-docs-truly-complete - scvi-tools 完整文档指南

scvi-tools 深度学习单细胞分析工具包完整文档助手

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更新于: 2026-06-30

能力

典型输入

典型输出

该技能可以做什么

  • 加载单细胞数据
  • 训练 SCVI 模型
  • 设置 AnnData
  • 运行差异表达分析
  • 执行批量校正
  • 转移细胞标签
  • 训练多模态模型
  • 调优超参数
  • 上传模型
  • 下载模型
  • 保存模型
  • 加载模型
  • 生成合成数据
  • 配置训练回调

输入

  • 单细胞数据文件
  • h5ad 文件
  • AnnData 对象
  • 模型参数
  • 训练参数
  • 细胞类型标签
  • 批次信息
  • 蛋白质表达数据
  • HuggingFace Hub 凭证

输出

  • 训练好的模型
  • 潜在空间表示
  • 差异表达结果
  • 细胞类型注释
  • 整合后的数据
  • 空间映射
  • 模型文件

要求

  • 已安装 scvi-tools
  • Python 环境
  • 深度学习框架
  • AnnData 支持
  • HuggingFace Hub 访问权限

来源

  • 规范: SKILL.md

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