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带有该标签的 Skills：Hi-C

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  • bio-hi-c-analysis-compartment-analysis - 使用 cooltools 从 Hi-C 数据中识别 A/B 染色质区室
    Hi-CAB区室cooltools染色质结构

    ★ 1 · 更新于 2026-09-19

    利用 cooltools 特征向量分解从 Hi-C 接触矩阵中检测 A/B 染色质区室并定量区室化强度。

    ⚙ 计算染色质区室特征向量⚙ 使用 GC 含量定向区室⚙ 提取 AB 区室分类
  • nested-TAD-detection - 使用OnTAD从Hi-C数据中检测嵌套TAD结构
    Hi-CTAD检测OnTAD嵌套TAD

    ★ 13 · 更新于 2026-06-30

    使用OnTAD从.cool、.mcool或.hic格式的Hi-C接触图谱中检测层级（嵌套）TAD结构，提取指定染色体的稠密矩阵并生成标准化的TAD调用文件。

    ⚙ 列出mcool可用分辨率⚙ 统一染色体命名⚙ 导出染色体信息