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  • cellchat - 使用 CellChat 分析细胞间通信
    单细胞空间转录组细胞间通信配体-受体

    ★ 98 · 更新于 2026-10-08

    从单细胞或空间转录组数据中分析、可视化并比较配体-受体细胞间通信网络。

    ⚙ 构建 CellChat 对象⚙ 推断配体-受体通信⚙ 聚合通路信号
  • scikit-bio - 分析生物与微生物组数据
    生物信息学序列分析系统发育微生物组

    ★ 0 · 更新于 2026-09-30

    分析生物序列、比对、系统发育树、多样性、排序、生态统计及相关文件格式。

    ⚙ 处理生物序列⚙ 比对生物序列⚙ 构建系统发育树
  • scvelo - 单细胞RNA速度分析工具
    单细胞RNA测序轨迹推断生物信息学

    ★ 5 · 更新于 2026-06-30

    从未剪接/已剪接mRNA动力学估计单细胞RNA测序数据中的细胞状态转换

    ⚙ 加载数据⚙ 过滤和归一化⚙ 计算矩
  • bio-ribo-seq-translation-efficiency - 基于Ribo-seq和RNA-seq数据计算翻译效率
    生物信息学翻译调控Ribo-seq分析

    ★ 650 · 更新于 2026-03-09

    计算翻译效率，即核糖体占有率与mRNA丰度的比值

    ⚙ 计算翻译效率⚙ 比较翻译调控⚙ 识别翻译变化