使用输入“FASTQ files”的 Skills

pysam - 基因组数据处理工具包
生物信息学基因组学 NGS 测序
★ 399 · 更新于 2026-06-15
读写 SAM/BAM/CRAM 比对、VCF/BCF 变异、FASTA/FASTQ 序列，用于 NGS 数据处理流程
⚙ 读取比对文件 ⚙ 写入比对文件 ⚙ 获取基因组区域
pysam - 基因组文件处理工具包
生物信息学基因组学 NGS 比对分析
★ 2 · 更新于 2026-06-15
读写 SAM/BAM/CRAM 比对、VCF/BCF 变异、FASTA/FASTQ 序列用于 NGS 数据处理
⚙ 打开比对文件 ⚙ 打开变异文件 ⚙ 打开序列文件
pysam - 基因组文件处理工具
生物信息学基因组学测序 NGS
★ 53 · 更新于 2026-06-15
读写基因组文件、查询区域、计算覆盖度，用于NGS数据处理
⚙ 读取对齐文件 ⚙ 写入对齐文件 ⚙ 读取变异文件
bio-splicing-pipeline - RNA-seq可变剪接分析流程
可变剪接 RNA测序差异分析生物信息学
★ 1,207 · 更新于 2026-03-25
从FASTQ到差异剪接结果的端到端可变剪接分析流程
⚙ 修剪FASTQ序列 ⚙ 比对RNA-seq数据 ⚙ 检测剪接位点饱和度
bio-longread-qc - 长读长测序数据质量控制
生物信息学长读长测序质量控制 ONT
★ 0 · 更新于 2026-03-21
使用NanoPlot、NanoStat和chopper对长读长测序数据进行质量控制
⚙ 读取FASTQ文件 ⚙ 读取BAM文件 ⚙ 读取测序摘要文件
bio-longread-qc - 长读长测序质量控制工具
长读长测序质量控制 Nanopore PacBio
★ 2 · 更新于 2026-03-21
使用 NanoPlot、NanoStat 和 chopper 对长读长测序数据进行质量控制
⚙ 生成读长分布图 ⚙ 创建质量得分图 ⚙ 计算汇总统计信息
bio-read-qc-quality-reports - 使用 FastQC 和 MultiQC 生成 FASTQ 质量报告
生物信息学质量控制 fastq 测序
★ 22 · 更新于 2026-02-11
使用 FastQC 从 FASTQ 文件生成质量报告，并使用 MultiQC 聚合报告
⚙ 运行 FastQC 分析 ⚙ 生成 HTML 报告 ⚙ 聚合多个报告
bio-read-qc-quality-reports - 使用FastQC和MultiQC生成并解读FASTQ质量报告
生物信息学质量控制测序 FASTQ
★ 33 · 更新于 2026-02-11
为FASTQ文件生成质量报告并汇总多个报告
⚙ 对FASTQ文件运行FastQC ⚙ 用MultiQC汇总报告 ⚙ 处理多个样本
bio-read-qc-quality-reports - 使用FastQC和MultiQC分析FASTQ文件质量
生物信息学质量控制测序 fastq
★ 650 · 更新于 2026-02-11
使用FastQC和MultiQC从FASTQ文件生成并解读质量报告
⚙ 运行FastQC分析 ⚙ 生成MultiQC报告 ⚙ 提取质量指标
bio-read-qc-quality-reports - FastQC 与 MultiQC 测序质量分析
质量控制测序分析生物信息学
★ 1,207 · 更新于 2026-02-11
使用 FastQC 和 MultiQC 生成并聚合 FASTQ 文件的质量报告
⚙ 使用 FastQC 生成质量报告 ⚙ 使用 MultiQC 聚合报告 ⚙ 评估每个碱基质量
sc-best-practices-auto - 单细胞分析最佳实践自动发现工具
单细胞生物信息学文档自动化
★ 22 · 更新于 2026-02-11
自动发现并抓取单细胞分析最佳实践的文档、HTML/MD文件和代码块
⚙ 发现文档索引 ⚙ 抓取HTML内容 ⚙ 提取MD文件